Ngày 18/11/1348, ông được Ashikaga Takauji đặt lên ngôi sau khi ông chú là Thiên hoàng Kōmyō vừa thoái vị.

Triều đại của ông chứng kiến cảnh hai anh em nhà Ashikaga là Ashikaga Takauji và Ashikaga Tadayoshi mâu thuẫn gay gắt về cách trị quốc.

Năm 1351, Takauji bất ngờ ngả về Nam triều khiến Thiên hoàng phải từ ngôi, rút về ẩn tại cung điện.